建于永樂十八年（1420），初名“大祀殿”，為一矩形大殿，用于合祀天、地。嘉靖二十四年（1545）改為三重檐圓殿，殿頂覆蓋上青、中黃、下綠三色琉璃，寓意天、地、萬物，并更名為“大享殿”。

乾隆十六年（1751），改三色瓦為統一的藍瓦金頂，定名“祈年殿”，是孟春（正月）祈谷的專用建筑。

祈年殿殿高38.2米，直徑24.2米，內部開間還分別寓意四季、十二月、十二時辰以及周天星宿。